MALDI-TOF MS ve 16S rDNA dizi analizi ile geleneksel olarak üretilen Mihaliç peynirinin mikrobiyotasının araştırılması

dc.contributor.advisorÇıbık, Recep
dc.contributor.authorAyanoğlu, Ergün
dc.contributor.departmentBursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/Besin Hijyeni ve Teknolojisi Anabilim Dalı.tr_TR
dc.contributor.orcid0000-0002-1774-2380tr_TR
dc.date.accessioned2021-10-19T08:02:35Z
dc.date.available2021-10-19T08:02:35Z
dc.date.issued2021-09-22
dc.description.abstractTez çalışmasında Mihaliç peynirinin laktik florası MALDI-TOF MS ve 16S rDNA dizi analizi yöntemleri ile karşılaştırmalı olarak tanımlandı. Araştırmada toplam 53 adet Mihaliç peyniri üretiminin en fazla yapıldığı Marmara Bölgesi’nden toplandı. Çalışmanın ilk bölümünde spesifik besiyerleri kullanılarak tüm laktik flora ortaya çıkartıldı ve seçilen 467 adet izolat MALDI-TOF-MS analizine tabi tutuldu. Besiyerlerinde üreyen mikroorganizmalar sayısal olarak değerlendirildiğinde M17 agarda gelişen streptokokların florada baskın olduğu belirlendi. Mikrooganizmaların tür tanısı için kullanılan MALDI-TOF-MS ve 16S rDNA dizi analiz sonuçlarına göre Lactobacillus fermentum (% 37,9), Lb. paracasei (% 32,5) ve Lb. rhamnosus (% 14,2) baskın laktobasil türleri olarak belirlendi. Benzer şekilde, Streptecoccus thermophilus (% 34), Str. gallolyticus ssp. macedonicus (% 31,9), Str. lutetiensis/Str. infantarius ssp. infantarius (% 14,8) ve Lactococcus lactis (% 12,7) M17’de üreyen stertekok ve laktokoklar olarak tanımlandı. Enterokoklar arasında ise KAA besiyerinden Enterococcus faecium (% 41,6) ve Ent. faecalis (% 38,5) en baskın türler olarak izole edilmiştir. Çalışmanın ikinci bölümünde tuzlu ve az tuzlu Mihaliç peynirleri ile bu peynirlerin kabuk (dış) ve iç (merkez) kısım mikrofloraları karşılaştırıldı. Sonuçta Lb. paracasei tuzlu peynirlere kıyasla az tuzlu peynirlerden daha sıklıkla izole edildi. Peynirlerin kabuk ve iç kısım karşılaştırmasında Lb. fermentum merkez kısımda daha yaygın olduğu, Ent. faecium’un ise kabuk kısmında daha baskın olduğu belirlendi. Elde edilen izolatlar ‘‘Süt Ürünleri Gen Bankası’’ starter kültür koleksiyonunda TSGB3001 başlangıç kodu ile kayıt ve muhafaza altına alındı. Bu suşların, peynir üretiminde potansiyel rollerinin anlaşılması için detaylı çalışmalara ihtiyaç vardır.tr_TR
dc.description.abstractComposition and diversity of lactic flora of Mihalic cheese was evaluated by using comparative analysis of MALDI-TOF MS and 16S rDNA sequencing of isolates. A total of 53 cheese samples were collected from Gönen, Savaştepe, Havran, Manyas, Karacabey provinces of Marmara Region where Mihalıç is produced largely in Turkey. In the first part of the study, the whole lactic flora was analyzed by planting the bacteria on specific media. In general, strepteccoci growing on M17 plates were predominant. A total of 467 isolates selected for their general status were then subjected to MALDI-TOF MS analysis. Combined analysis of MALDI-TOF MS and 16S rDNA sequencing evidenced Lactobacillus fermentum, Lb. paracasei and Lb. rhamnosus as the dominant lactobacilles with a percentage of 37,9 %, 32,5 % and 14,2 % respectively. Percentage distribution for streptococci was 34 % for Streptecoccus thermophilus, 31,9 for Str. gallolyticus ssp. macedonicus, 14,8 % for Str. lutetiensis/Str. infantarius ssp. infantarius and 12,7 % for Lactoccus lactis. Among enterococci, Enterococcus faecium (41,6 %) and Ent. faecalis (38,5 %) were the most dominant species. In the second part of the study microflora of salty/lesser salty and central/crust part of Mihalic was compared. Lb. paracasei was the mostly isolated lactobacilli species in lesser salty cheese compared to salty ones. Comparison of central and crust part of cheeses revealed that Lb. fermentum count was higher in central part whereas Ent. faecium was dominant in crust part. Collected isolates were stored in ‘‘Dairy Product Gene Bank’' starter culture collection under TSGB3001 code and further studies are necessary to better understand their potential role in cheese manufacturing.en_US
dc.description.sponsorshipTAGEM/HSGYAD/A/18/A3/P7/24-Tarım ve Orman Bakanlığı Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğütr_TR
dc.format.extentIX, 132 sayfatr_TR
dc.identifier.citationAyanoğlu, E. (2021). MALDI-TOF MS ve 16S rDNA dizi analizi ile geleneksel olarak üretilen Mihaliç peynirinin mikrobiyotasının araştırılması. Yayınlanmamış doktora tezi. Bursa Uludağ Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü.tr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11452/22400
dc.language.isotrtr_TR
dc.publisherBursa Uludağ Üniversitesitr_TR
dc.relation.publicationcategoryTeztr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectMihaliç peyniritr_TR
dc.subjectMALDI-TOFtr_TR
dc.subject16S rDNA dizi analizitr_TR
dc.subjectKültür koleksiyonutr_TR
dc.subjectMihalic cheeseen_US
dc.subject16S rDNA sequence analysisen_US
dc.subjectCulture collectionen_US
dc.titleMALDI-TOF MS ve 16S rDNA dizi analizi ile geleneksel olarak üretilen Mihaliç peynirinin mikrobiyotasının araştırılmasıtr_TR
dc.title.alternativeInvestigation of microbiota of traditionally produced Mihaliç cheese by MALDI TOF MS and 16S rDNA sequence analysisen_US
dc.typedoctoralThesisen_US

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Ergün AYANOĞLU.pdf
Size:
2.89 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: