Publication:
Türkiye’de altı yıllık zaman dilimi içerisinde kan kültürlerinden soyutlanan maya mantarlarının tür dağılımı: Çok merkezli bir çalışma

dc.contributor.authorErgon, M. Cem
dc.contributor.authorDereli, Mine Doluca
dc.contributor.authorAtalay, M. Altay
dc.contributor.authorKoç, A. Nedret
dc.contributor.authorÇerikçioğlu, Nilgün
dc.contributor.authorErturan, Zayre
dc.contributor.authorAksaray, Sebahat
dc.contributor.buuauthorEner, Beyza
dc.contributor.departmentTıp Fakültesi
dc.contributor.departmentTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
dc.contributor.orcid0000-0002-4803-8206
dc.contributor.researcheridAAG-8523-2021
dc.contributor.scopusid15053025300
dc.date.accessioned2023-10-23T07:16:08Z
dc.date.available2023-10-23T07:16:08Z
dc.date.issued2020-09
dc.description.abstractMaya mantarları, başta Candida türleri olmak üzere yüksek mortalite ve morbidite ile seyreden sağlık hizmeti ile ilişkili kan enfeksiyonlarına neden olmaktadır. Kandidemiler, hastanelerde uzamış yatış süreleri ve artan maliyetlere neden olmaktadır. Hayatı tehdit eden bu kan enfeksiyonlarını başarılı bir şekilde önlemek veya tedavi edebilmek için etkenler ile ilgili ulusal epidemiyolojik veriler hazır olmalıdır. Türkiye’de, çok merkezli ulusal kandidemi verisi eksiktir. Bu retrospektif çalışmada, klinisyenlerin erken ve uygun antifungal tedavi seçimlerine katkıda bulunabilmek amacıyla, Türkiye’deki altı farklı merkezden 2011-2016 yılları arasındaki veriler toplanarak maya türlerinin dağılımı ve sıklığı analiz edilmiştir. Çalışma kapsamında yer alan tüm laboratuvarlarda izolatların eldesi için otomatize kan kültür sistemleri kullanılmıştır. İzolatların tanımlanması, çalışmada yer alan merkezlerin kendileri tarafından çimlenme borusu testi, mısır unlu tween 80 agar ve kromojenik besiyerindeki görünüm gibi konvansiyonel yöntemlerle gerçekleştirildikten sonra API 20C AUX, API ID 32C veya “matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrophotometry (MALDI-TOF MS)” yöntemleri ile doğrulanmıştır. Sonuçlar, yoğun bakım üniteleri (YBÜ),diğer yatan hasta klinikleri (DYHK) ve toplam tüm klinikler (TK) bazında değerlendirilmiştir. Çalışmada yer alan merkezlerden altı yıllık dönemde, 2.547 maya izolatı elde edilmiştir. Toplam TK verilerine göre, en sık saptanan maya türü Candida albicans (%43.1) olurken, bu türü Candida parapsilosis kompleks (%29.1), Candida glabrata (%10.1), Candida tropicalis (%7.5), Candida krusei (%2.4), Candida kefyr (%1.6) ve diğer maya türleri (%6.2) izlemiştir. Candida türlerinin yıllara göre dağılımında, C.parapsilosis kompleks için 2016 yılında gözlenen artış (p= 0.02) dışında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmamıştır. Çalışma süresince, merkezlerin YBÜ’lerinden toplam 1.054 maya izolatı elde edilmiştir. YBÜ’lerde, C.albicans 476 (%45.2) izolat ile ilk sırada yer alırken, C.parapsilosis kompleks (%28.7), C.glabrata (%10.7) ve C.tropicalis (%7.3) bu türü izlemiştir. Çalışmada yer alan altı merkezin DYHK’lerinden elde edilen toplam 1.493 maya izolatı içerisinde 622 (%41.7) izolat ile C.albicans en sık saptanan tür olmuştur. DYHK’lerde sık saptanan diğer türler, YBÜ’lerdeki sonuçlara benzer şekilde C.parapsilosis kompleks (%29.5), C.glabrata (%9.6) ve C.tropicalis (%7.6) olarak belirlenmiştir. Sonuç olarak, Türkiye’nin farklı coğrafi bölgelerinde yer alan altı farklı merkezde C.albicans, halen fungal kan enfeksiyonlarının en sık nedenidir.
dc.description.abstractBloodstream infections due to yeast species especially Candida spp. have been reported to be important healthcare associated infections with high mortality and morbidity rates. Candidemia causes prolonged hospital stays as well as increased cost. In order to prevent or treat these life-threatening bloodstream infections successfully, nationwide epidemiological data should be available about the etiological agents of these infections. Multi-centre national epidemiological data on yeast bloodstream infections in Turkey is lacking. A retrospective study was designed and data from six different centres in Turkey between 2011 and 2016 years were gathered and analysed for the distribution and frequency of yeast species in order to assist clinicians in their choice of early and appropriate antifungal therapy. All laboratories used automated blood culture systems for the isolation of blood strains. All the participating centres performed the identification of their own isolates by conventional methods using germ tube test, morphology on corn meal agar with tween 80 and chromogenic media and the identification was confirmed by API 20C AUX, API ID 32C or matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrophotometry (MALDI-TOF MS) systems. The analysis of the results was performed on the basis of intensive care units (ICUs), other inpatient clinics (OICs) and totally all clinics (ACs). Totally 2547 yeast isolates were determined from six participating centres during six years. According to the total ACs results, Candida albicans was the most prevalent species (43.1%), followed by Candida parapsilosis complex (29.1%), Candida glabrata (10.1%), Candida tropkalis (7.5%), Candida krusei (2.4%) and Candida kefyr (1.6%) and the remaining (6.2%) of them consisted of other yeast species. The distribution of the Candida species did not show statistically significant difference between the years, however the increase of C.parapsilosis complex in 2016 was statistically significant, (p= 0.02). During the study period, totally 1054 yeast isolates were obtained from the ICUs of the centres. C.albicans predominated with 476 (45.2%) isolates and C.parapsilosis complex (28.7%), C.glabrata (10.7%) and C.tropicalis (7.3%) were the other leading species in ICUs. Among 1493 isolates of the OICs of six centres participated in the study, C.albicans was the most prevalent species with 622 (41.7%) isolates. The other frequent species of OICs were C.parapsilosis complex (29.5%), C.glabrata (9.6%) and C.tropicalis (7.6%) resembling ICU results. It can be concluded that C.albicans is still the leading cause of bloodstream infections in the six different centres located in various geographical areas of Turkey.
dc.identifier.citationErgon, M. C. vd. (2020). "Türkiye’de altı yıllık zaman dilimi içerisinde kan kültürlerinden soyutlanan maya mantarlarının tür dağılımı: Çok merkezli bir çalışma". Mikrobiyoloji Bulteni, 54(4),638-646.
dc.identifier.endpage646
dc.identifier.issn0374-9096
dc.identifier.issue4
dc.identifier.pubmed33107293
dc.identifier.scopus2-s2.0-85094832532
dc.identifier.startpage638
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.5578/mb.69837
dc.identifier.urihttp://www.mikrobiyolbul.org/linkout.aspx?pmid=33107293
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11452/34508
dc.identifier.volume54
dc.identifier.wos000582397200012
dc.indexed.scopusScopus
dc.indexed.trdizinTrDizin
dc.indexed.wosSCIE
dc.language.isotr
dc.publisherAnkara Mikrobiyoloji Derneği
dc.relation.collaborationYurt içi
dc.relation.journalMikrobiyoloji Bulteni
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectMaya
dc.subjectEpidemiyoloji
dc.subjectKan kültürü
dc.subjectKandidemi
dc.subjectTürkiye
dc.subjectMicrobiology
dc.subjectYeast
dc.subjectEpidemiology
dc.subjectBlood culture
dc.subjectCandidemia
dc.subjectTurkey
dc.subjectIntensive-care-unit
dc.subjectStream infections
dc.subjectCandidemia
dc.subjectEpidemiology
dc.subjectCandidaemia
dc.subjectNationwide
dc.subjectTrends
dc.subjectResistance
dc.subjectOutcomes
dc.subject.emtreeAntifungal agent
dc.subject.emtreeBlood culture
dc.subject.emtreeClinical trial
dc.subject.emtreeEpidemiology
dc.subject.emtreeKluyveromyces
dc.subject.emtreeMicrobial sensitivity test
dc.subject.emtreeMulticenter study
dc.subject.emtreePhylogeny
dc.subject.emtreePichia
dc.subject.emtreeRetrospective study
dc.subject.emtreeTurkey (bird)
dc.subject.meshAntifungal agents
dc.subject.meshBlood culture
dc.subject.meshKluyveromyces
dc.subject.meshMicrobial sensitivity tests
dc.subject.meshPhylogeny
dc.subject.meshPichia
dc.subject.meshRetrospective studies
dc.subject.meshTurkey
dc.subject.scopusCandidemia; Invasive candidiasis; Antifungal agents
dc.subject.wosMicrobiology
dc.titleTürkiye’de altı yıllık zaman dilimi içerisinde kan kültürlerinden soyutlanan maya mantarlarının tür dağılımı: Çok merkezli bir çalışma
dc.title.alternativeDistribution of yeast species isolated from blood cultures for a six year period in turkey: A multicentre study
dc.typeArticle
dc.wos.quartileQ4
dc.wos.quartileQ4
dspace.entity.typePublication
local.contributor.departmentTıp Fakültesi/Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
local.indexed.atPubMed
local.indexed.atWOS
local.indexed.atScopus

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
Ergon_vd_2020.pdf
Size:
392.51 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Placeholder
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: