Publication:
Türkiye’de altı yıllık zaman dilimi içerisinde kan kültürlerinden soyutlanan maya mantarlarının tür dağılımı: Çok merkezli bir çalışma

dc.contributor.authorErgon, M. Cem
dc.contributor.authorDereli, Mine Doluca
dc.contributor.authorAtalay, M. Altay
dc.contributor.authorKoç, A. Nedret
dc.contributor.authorÇerikçioğlu, Nilgün
dc.contributor.authorErturan, Zayre
dc.contributor.authorAksaray, Sebahat
dc.contributor.buuauthorEner, Beyza
dc.contributor.departmentTıp Fakültesi
dc.contributor.departmentTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
dc.contributor.orcid0000-0002-4803-8206tr_TR
dc.contributor.researcheridAAG-8523-2021tr_TR
dc.contributor.scopusid15053025300tr_TR
dc.date.accessioned2023-10-23T07:16:08Z
dc.date.available2023-10-23T07:16:08Z
dc.date.issued2020-09
dc.description.abstractMaya mantarları, başta Candida türleri olmak üzere yüksek mortalite ve morbidite ile seyreden sağlık hizmeti ile ilişkili kan enfeksiyonlarına neden olmaktadır. Kandidemiler, hastanelerde uzamış yatış süreleri ve artan maliyetlere neden olmaktadır. Hayatı tehdit eden bu kan enfeksiyonlarını başarılı bir şekilde önlemek veya tedavi edebilmek için etkenler ile ilgili ulusal epidemiyolojik veriler hazır olmalıdır. Türkiye’de, çok merkezli ulusal kandidemi verisi eksiktir. Bu retrospektif çalışmada, klinisyenlerin erken ve uygun antifungal tedavi seçimlerine katkıda bulunabilmek amacıyla, Türkiye’deki altı farklı merkezden 2011-2016 yılları arasındaki veriler toplanarak maya türlerinin dağılımı ve sıklığı analiz edilmiştir. Çalışma kapsamında yer alan tüm laboratuvarlarda izolatların eldesi için otomatize kan kültür sistemleri kullanılmıştır. İzolatların tanımlanması, çalışmada yer alan merkezlerin kendileri tarafından çimlenme borusu testi, mısır unlu tween 80 agar ve kromojenik besiyerindeki görünüm gibi konvansiyonel yöntemlerle gerçekleştirildikten sonra API 20C AUX, API ID 32C veya “matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrophotometry (MALDI-TOF MS)” yöntemleri ile doğrulanmıştır. Sonuçlar, yoğun bakım üniteleri (YBÜ),diğer yatan hasta klinikleri (DYHK) ve toplam tüm klinikler (TK) bazında değerlendirilmiştir. Çalışmada yer alan merkezlerden altı yıllık dönemde, 2.547 maya izolatı elde edilmiştir. Toplam TK verilerine göre, en sık saptanan maya türü Candida albicans (%43.1) olurken, bu türü Candida parapsilosis kompleks (%29.1), Candida glabrata (%10.1), Candida tropicalis (%7.5), Candida krusei (%2.4), Candida kefyr (%1.6) ve diğer maya türleri (%6.2) izlemiştir. Candida türlerinin yıllara göre dağılımında, C.parapsilosis kompleks için 2016 yılında gözlenen artış (p= 0.02) dışında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmamıştır. Çalışma süresince, merkezlerin YBÜ’lerinden toplam 1.054 maya izolatı elde edilmiştir. YBÜ’lerde, C.albicans 476 (%45.2) izolat ile ilk sırada yer alırken, C.parapsilosis kompleks (%28.7), C.glabrata (%10.7) ve C.tropicalis (%7.3) bu türü izlemiştir. Çalışmada yer alan altı merkezin DYHK’lerinden elde edilen toplam 1.493 maya izolatı içerisinde 622 (%41.7) izolat ile C.albicans en sık saptanan tür olmuştur. DYHK’lerde sık saptanan diğer türler, YBÜ’lerdeki sonuçlara benzer şekilde C.parapsilosis kompleks (%29.5), C.glabrata (%9.6) ve C.tropicalis (%7.6) olarak belirlenmiştir. Sonuç olarak, Türkiye’nin farklı coğrafi bölgelerinde yer alan altı farklı merkezde C.albicans, halen fungal kan enfeksiyonlarının en sık nedenidir.tr_TR
dc.description.abstractBloodstream infections due to yeast species especially Candida spp. have been reported to be important healthcare associated infections with high mortality and morbidity rates. Candidemia causes prolonged hospital stays as well as increased cost. In order to prevent or treat these life-threatening bloodstream infections successfully, nationwide epidemiological data should be available about the etiological agents of these infections. Multi-centre national epidemiological data on yeast bloodstream infections in Turkey is lacking. A retrospective study was designed and data from six different centres in Turkey between 2011 and 2016 years were gathered and analysed for the distribution and frequency of yeast species in order to assist clinicians in their choice of early and appropriate antifungal therapy. All laboratories used automated blood culture systems for the isolation of blood strains. All the participating centres performed the identification of their own isolates by conventional methods using germ tube test, morphology on corn meal agar with tween 80 and chromogenic media and the identification was confirmed by API 20C AUX, API ID 32C or matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrophotometry (MALDI-TOF MS) systems. The analysis of the results was performed on the basis of intensive care units (ICUs), other inpatient clinics (OICs) and totally all clinics (ACs). Totally 2547 yeast isolates were determined from six participating centres during six years. According to the total ACs results, Candida albicans was the most prevalent species (43.1%), followed by Candida parapsilosis complex (29.1%), Candida glabrata (10.1%), Candida tropkalis (7.5%), Candida krusei (2.4%) and Candida kefyr (1.6%) and the remaining (6.2%) of them consisted of other yeast species. The distribution of the Candida species did not show statistically significant difference between the years, however the increase of C.parapsilosis complex in 2016 was statistically significant, (p= 0.02). During the study period, totally 1054 yeast isolates were obtained from the ICUs of the centres. C.albicans predominated with 476 (45.2%) isolates and C.parapsilosis complex (28.7%), C.glabrata (10.7%) and C.tropicalis (7.3%) were the other leading species in ICUs. Among 1493 isolates of the OICs of six centres participated in the study, C.albicans was the most prevalent species with 622 (41.7%) isolates. The other frequent species of OICs were C.parapsilosis complex (29.5%), C.glabrata (9.6%) and C.tropicalis (7.6%) resembling ICU results. It can be concluded that C.albicans is still the leading cause of bloodstream infections in the six different centres located in various geographical areas of Turkey.en_US
dc.identifier.citationErgon, M. C. vd. (2020). "Türkiye’de altı yıllık zaman dilimi içerisinde kan kültürlerinden soyutlanan maya mantarlarının tür dağılımı: Çok merkezli bir çalışma". Mikrobiyoloji Bulteni, 54(4),638-646.tr_TR
dc.identifier.endpage646tr_TR
dc.identifier.issn0374-9096
dc.identifier.issue4tr_TR
dc.identifier.pubmed33107293tr_TR
dc.identifier.scopus2-s2.0-85094832532tr_TR
dc.identifier.startpage638tr_TR
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.5578/mb.69837
dc.identifier.urihttp://www.mikrobiyolbul.org/linkout.aspx?pmid=33107293
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11452/34508
dc.identifier.volume54tr_TR
dc.identifier.wos000582397200012
dc.indexed.pubmedPubMeden_US
dc.indexed.scopusScopusen_US
dc.indexed.trdizinTrDizintr_TR
dc.indexed.wosSCIEen_US
dc.language.isotrtr_TR
dc.publisherAnkara Mikrobiyoloji Derneğitr_TR
dc.relation.collaborationYurt içitr_TR
dc.relation.journalMikrobiyoloji Bultenien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergitr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectMayatr_TR
dc.subjectEpidemiyolojitr_TR
dc.subjectKan kültürütr_TR
dc.subjectKandidemitr_TR
dc.subjectTürkiyetr_TR
dc.subjectMicrobiologyen_US
dc.subjectYeasten_US
dc.subjectEpidemiologyen_US
dc.subjectBlood cultureen_US
dc.subjectCandidemiaen_US
dc.subjectTurkeyen_US
dc.subjectIntensive-care-uniten_US
dc.subjectStream infectionsen_US
dc.subjectCandidemiaen_US
dc.subjectEpidemiologyen_US
dc.subjectCandidaemiaen_US
dc.subjectNationwideen_US
dc.subjectTrendsen_US
dc.subjectResistanceen_US
dc.subjectOutcomesen_US
dc.subject.emtreeAntifungal agenten_US
dc.subject.emtreeBlood cultureen_US
dc.subject.emtreeClinical trialen_US
dc.subject.emtreeEpidemiologyen_US
dc.subject.emtreeKluyveromycesen_US
dc.subject.emtreeMicrobial sensitivity testen_US
dc.subject.emtreeMulticenter studyen_US
dc.subject.emtreePhylogenyen_US
dc.subject.emtreePichiaen_US
dc.subject.emtreeRetrospective studyen_US
dc.subject.emtreeTurkey (bird)en_US
dc.subject.meshAntifungal agentsen_US
dc.subject.meshBlood cultureen_US
dc.subject.meshKluyveromycesen_US
dc.subject.meshMicrobial sensitivity testsen_US
dc.subject.meshPhylogenyen_US
dc.subject.meshPichiaen_US
dc.subject.meshRetrospective studiesen_US
dc.subject.meshTurkeyen_US
dc.subject.scopusCandidemia; Invasive candidiasis; Antifungal agentsen_US
dc.subject.wosMicrobiologyen_US
dc.titleTürkiye’de altı yıllık zaman dilimi içerisinde kan kültürlerinden soyutlanan maya mantarlarının tür dağılımı: Çok merkezli bir çalışmatr_TR
dc.title.alternativeDistribution of yeast species isolated from blood cultures for a six year period in turkey: A multicentre studyen_US
dc.typeArticle
dc.wos.quartileQ4en_US
dspace.entity.typePublication
local.contributor.departmentTıp Fakültesi/Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalıtr_TR
local.indexed.atTrDizin

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Ergon_vd_2020.pdf
Size:
392.51 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description:

Collections