Browsing by Author "Kaya, Mehmet Onur"
Now showing 1 - 4 of 4
- Results Per Page
- Sort Options
Item Examination of published articles with respect to statistical errors in veterinary sciences(Sciendo, 2016-12-07) Mankir, Seray; Ercan, İlker; Kaya, Mehmet Onur; Uzabacı, Ender; Can, Fatma Ezgi; Bashir, Albishir Musa; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Biyoistatistik Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Biyoistatistik Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/Biyoistatistik Anabilim Dalı.; 0000-0001-8052-0484; 0000-0002-9634-0055; 0000-0002-1953-7735; 0000-0002-2382-290X; ABF-2367-2020; V-9415-2018; 6603789069; 56689249200; 55347697800; 56689608500; 57193810863The aim of this present work was to examine statistical errors in published veterinary science articles. A total of 204 published articles (SCI or SCI-Exp) were used in this study. The articles were chosen from among those indexed in PubMed database between the years 2010 and 2014, inclusive. A total of 199 articles had at least one statistical error. The most frequently encountered statistical error among the articles published in journals indexed in SCI and in SCI-E was "errors in summarizing data". No statistical error was found in 2.45% (n=5) of 204 (SCI: 0.98% (1/102), SCI-E: 3.92% (4/102)) articles. To reduce and prevent statistical errors in publications, the researchers must have a basic knowledge of statistics and during the study process they must consult field experts. While reviewing, the reviewers have to redirect the publications to statistical editors when needed and most importantly during the process of editing, the editors have to direct the publications to a statistics reviewer.Item Memenin fibroepitelyal lezyonlarının US bulgularının eksizyonel biyopsi sonuçlarıyla karşılaştırılması(Bursa Uludağ Üniversitesi, 2021-04-16) Kandemirli, Sedat Giray; Kaya, Mehmet Onur; Gürsel, Başak Erdemli; Tolunay, Şahsine; Topal, Naile Bolca; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Radyoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı.; 0000-0002-0047-1780; 0000-0002-9038-0515; 0000-0002-4821-242XÇalışmamızın amacı, ultrasonografi (US) eşliğinde kesici iğne biyopsi (KİB) sonucu fibroepitelyal lezyon (FEL) olan lezyonların klinik ve US bulgularını, patolojik ayrımda kullanılan Ki-67 indeksini, eksizyonel biyopsi sonuçlarıyla karşılaştırarak ayırımda yararlı olabilecek bulguların araştırılmasıdır. 2009-2013 yılları arasında US eşliğinde KİB yapılmış 50 olguda, sonucu FEL olan 53 lezyon değerlendirilmiştir. Elliüç lezyonun 43’ü histopatolojik olarak FA, 10 tanesi de filloides tümör (FT) tanısı almıştır. Hastaların klinik bulguları, lezyonların BIRADS sınıflamasına göre yapılan ultrasonografik özellikleri ve KİB preparatlarının Ki-67 proliferatif indeks değerleri belirlenmiştir. Ayrıca meme radyolojisi konusunda 20 yıllık deneyim olan bir radyolog, eksizyon sonuçlarını bilmeden, lezyonların sonografik görüntülerini yorumlamıştır. Buna göre hiçbir klinik ve ultrasonografik parametrenin FA ve FT ayrımında özgün olmadığı sonucuna ulaşılmıştır. KİB preparatlarından yapılan Ki-67 proliferatif indeks değerleri de ayırıcı tanıya katkı sağlamamıştır. Ancak meme radyolojisi konusunda uzman radyoloğun öngörüsü ile cerrahi sonuçlar arasında istatistiksel olarak anlamlı uyumluluk bulunmuştur. Bu nedenle KİB sonucu FEL gelen ancak uzman radyoloğun benign olarak yorumladığı seçilmiş olgularda yakın takip alternatif bir seçenek olarak değerlendirilebilir.Item ODDS oranının birleştirilmesinde kullanılan mantel haenszel ve peto yöntemlerinin karşılaştırılması(Uludağ Üniversitesi, 2016-12-16) Kaya, Mehmet Onur; Ocakoğlu, Gökhan; Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/Biyoistatistik Anabilim Dalı.Meta analizi, farklı yer, zaman ve farklı birimler seçilerek yapılmış araştırmaları uygun biçimde bir araya getirerek anakütle için parametre tahminleri yapmayı amaçlayan bir yöntemdir. Tez çalışmasında, ikili değer alan veriler için özet istatistiği olan odds oranını (OR) birleştirmek için kullanılan meta analizi yöntemlerinden en çok tercih edilen Mantel Haenszel ve Peto yöntemlerinin etkinlikleri karşılaştırılmıştır. İlk bölümde, Cochran Q testine göre meta analizine alınan çalışmaların homojen olduğu, ikinci bölümde ise Cochran Q testine göre meta analizine alınan çalışmaların heterojen olduğu durumlara ait farklı örneklem büyüklükleri, farklı çalışma sayıları ve farklı etken olma olasılıklarına sahip verilerden OR'ler üretilerek Mantel Haenszel ve Peto yöntemleri uygulanmıştır. Simülasyon sonuçlarından yararlanarak, Mantel Haenszel ve Peto yöntemlerinin, OR birleştirmedeki etkinliklerinin çalışma sayısından, örneklem büyüklüğünden ve hastalık-etken oranlarından etkilenip etkilenmedikleri ve hangi yöntemin daha tutarlı sonuçlar verdiği ortaya konmaya çalışılmıştır. Yöntemlerin tutarlılığını karşılaştırmak amacıyla, iki ölçüden yararlanılmıştır. Ölçülerden ilki relatif bias ve diğeri ise relatif hata kareleri ortalamasıdır. Sonuç olarak, gerek çalışmaların homojen olduğu durum gerekse çalışmaların heterojen olduğu durum göz önüne alındığında, her iki yöntemin örneklem büyüklüğü değişiminden etkilenirken analize alınan çalışma sayısından etkilenmediği ve Peto yönteminin Mantel Haenszel yöntemine göre daha tutarlı ve iyi tahmin sonuçları verdiği görülmektedir.Item Statistical shape analysis of subthalamic nucleus in patients with parkinson disease(Elsevier Science Inc, 2019-06) Öztürk, Sait; Gönen, Murat; Erol, Fatih Serhat; Kocabıçak, Ersoy; Kaya, Mehmet Onur; Ercan, İlker; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Biyoistatistik Anabilim Dalı.; 0000-0001-8052-0484; V-9415-2018; ABF-2367-2020; 56689249200; 6603789069Objective: Subthalamic nucleus (STN) is the most targeted localization in the treatment of Parkinson disease (PD) with deep brain stimulation. However, no studies have been found in the literature about possible shape changes of STN in the literature. We aimed to investigate possible shape changes in the STN and the relationship between shape changes and disease duration in PD patients by using statistical analysis. Methods: Patients who were diagnosed with idiopathic PD and controls were enrolled in this study. Age, sex, and disease duration of all cases were recorded. Turbo-spin-echo T2-weighted axial series parallel to the skull base in each case containing midbrain images were obtained, including the whole STN. Standard anatomic landmarks were selected and marked on each digital image using a special software in all cases. Statistical geometric shape and deformation analysis of STN was performed in 2 groups. Results: Forty-three patients with PD and 50 age/sex-matched controls were enrolled in this study. There were statistically significant left and right STN shape differences between the groups. Maximum deformation was seen in the dorsolateral parts of both STNs. General shape variability of the STNs was found on the left (0.096) and right (0.049). Conclusions: Significant shape differences and remarkable deformation of STN are seen in patients with PD compared with controls. Maximum deformation was observed in the dorsolateral part of the STN, and with the increase in the duration of the PD, shape differences and deformations became more prominent.