Browsing by Author "Şimşek, Abdurrahman"

Now showing 1 - 7 of 7

Association of cytotoxic T lymphocyte subsets with disease severity in Covid-19
(Wiley, 2021-08-01) Kızmaz, Muhammed Ali; Çağan, Eren; Şimşek, Abdurrahman; Dombaz, Fatma; Tezcan, Gülçin; Aşan, Ali; Demir, H. İbrahim; Bal, S. Haldun; Ermiş, Diğdem Yöyen; Coşkun, Necmiye Funda; Akalın, E. Halis; Oral, Haluk Barbaros; Budak, Ferah; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; Dombaz, Fatma; TEZCAN, GÜLÇİN; Demir, H. İbrahim; BAL, SALİH HALDUN; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; COŞKUN, NECMİYE FUNDA; AKALIN, EMİN HALİS; ORAL, HALUK BARBAROS; BUDAK, FERAH; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Diş Hekimliği Fakültesi/Temel Bilimler Bölümü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-5956-8755; 0000-0002-8856-7356; 0000-0001-7585-7971; 0000-0003-3604-8826; 0000-0001-7530-1279; 0000-0003-0463-6818; 0000-0001-7625-9148; 0000-0003-3604-8826; HKN-2347-2023; IZP-9398-2023; AAH-3843-2020; F-4657-2014; AAG-7381-2021; K-7285-2012; AAU-8952-2020; DWR-5356-2022; GPN-1473-2022; KBR-5535-2024; GYL-2038-2022; AAD-1271-2019
Brusellozlu hastalarda eksozom profilinin değerlendirilmesi
(Bursa Uludağ Üniversitesi, 2021-06-22) Şimşek, Abdurrahman; Budak, Ferah; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/İmmünoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-8850-0269
Bruselloz, etkeni Brucella bakterileri olan dünya çapında zoonotik bir enfeksiyondur. Eksozomlar, birçok hücre tipi tarafından salınan multiveziküler gövdelerden türetilen küçük lipit veziküllerdir. Eksozomal hücre kargosu, kökenlendiği hücrenin tipini yansıtır. Bu çalışmada akut, kronik bruselloz ve sağlıklı kontrollerden alınan serum örneklerinden elde edilen eksozomların Akan Hücre Ölçer (AHÖ) yardımıyla immünfenotiplemesini yapmak, farklı gruplarda eksozomların hangi hücre gruplarından köken aldığını belirlemek, brusellozun kronikleşmesinde, eksozomların etkisini ortaya koymak ve bruselloz immünpatogenezinde eksozomların potansiyel rollerine dair literatüre katkılar sunmak amaçlanmıştır. Çalışmamıza, bruselloz tanısı konmuş 10 akut ve 10 kronik hasta ile 10 sağlıklı kontrol dahil edilmiştir. Serum örneklerinden eksozomlar ticari izolasyon kiti kullanılarak elde edilmiştir. Önceden tasarlanan panelde, monoklonal antikorlarla boyandıktan sonra, AHÖ ’de eksozomların immünfenotiplemesi yapılmıştır. Eksozom varlığının doğrulanması, eksozoma spesifik monoklonal antikorlar olan CD9, CD63 ve CD81 boyamaları ve elektron mikroskobu (SEM) değerlendirmeleriyle yapılmıştır. Değerlendirme sonucuna göre granülosit kökenli eksozom değerleri akut grupta, kronik ve sağlıklı gruba göre anlamlı derecede yüksek çıkmıştır, bunun yanında kronik ve sağlıklı grup arasında anlamlı bir fark gözlenmemiştir. G-MDSC (granülositik-myeloid kökenli süpressör hücreler) kökenli eksozom değerleri, akut grupta kronik ve sağlıklı gruba göre anlamlı derecede yüksek bulunmuştur, aynı zamanda kronik grup ve sağlıklı kontrol grubu arasında anlamlı derecede farklılık gözlenmiştir. Tez çalışması sonucunda, akut dönemde hastalığın patogenezinde granülosit kökenli eksozomların rol oynadığı ve ortamda bulunan myeloid kökenli supressör hücrelerden kaynaklanan eksozomlarında granülosit kökenli eksozomlar olduğu bulunmuştur. Brusellozun farklı evrelerinde, granülosit kökenli ve G-MDSC kökenli eksozomlar arasındaki anlamlı farklar, hastalığın immünpatolojisine, yeni çalışmalarla birlikte önemli katkılar sunabilir.
Evaluation of the roles of regulatory B (Breg) cells and B cell exhaustion in COVID-19
(Wiley, 2021-08-01) Budak, Ferah; Çağan, Eren; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimşek, Abdurrahman; Dombaz, Fatma; Tezcan, Gülçin; Asan, Ali; Bal, S. Haldun; Ermiş, Diğdem Yöyen; Demir, H. İbrahim; Ediger, Dane; Yılmaz, Emel; Oral, Haluk Barbaros; Akalın, E. Halis; BUDAK, FERAH; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; Dombaz, Fatma; TEZCAN, GÜLÇİN; BAL, SALİH HALDUN; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; Demir, H. İbrahim; EDİGER, DANE; YILMAZ, EMEL; ORAL, HALUK BARBAROS; AKALIN, EMİN HALİS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Diş Hekimliği Fakültesi/Temel Bilimler Bölümü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-7625-9148; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-5956-8755; 0000-0002-8856-7356; 0000-0001-7585-7971; 0000-0002-2954-4293; 0000-0003-1785-3539; 0000-0003-0463-6818; 0000-0001-7530-1279; AAG-7381-2021; AAH-3843-2020; K-7285-2012; F-4657-2014; IZP-9398-2023; AAU-8952-2020; HKN-2347-2023; DWR-5356-2022; KBR-5535-2024; GYL-2038-2022; GPN-1473-2022; AAE-9142-2019; GDP-0005-2022
New biological markers in the diagnosis and follow-up of brucellosis
(Wiley, 2021-08-01) Çagan, Eren; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimşek, Abdurrahman; Akalın, Halis; Oral, Haluk Barbaros; Budak, Ferah; Çagan, Eren; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; AKALIN, EMİN HALİS; ORAL, HALUK BARBAROS; BUDAK, FERAH; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Anabilim Dalı.; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-7530-1279; 0000-0003-0463-6818; 0000-0001-7625-9148; HJI-2036-2023; HKN-2347-2023; K-7285-2012; F-4657-2014; IZP-9398-2023; AAG-7381-2021; AAU-8952-2020
Relationship of exosome profile with acute and chronic inflammation in brucellosis
(Wiley, 2021-08-01) Şimşek, Abdurrahman; Kızmaz, Muhammed Ali; Ellergezen, Pınar Hız; Bal, Salih Haldün; Bozkurt, Tuğçe; Akalın, Emin Halis; Oral, Haluk Barbaros; Yılmaz, Özer; Budak, Ferah; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; Kızmaz, Muhammed Ali; Ellergezen, Pınar Hız; BAL, SALİH HALDUN; Bozkurt, Tuğçe; AKALIN, EMİN HALİS; ORAL, HALUK BARBAROS; YILMAZ, ÖZER; BUDAK, FERAH; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Enfeksiyon ve Klinik Mikrobiyolojisi Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Fen-Edebiyat Fakültesi/Biyoloji Bölümü.; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-5144-091X; 0000-0001-7530-1279; 0000-0003-0463-6818; 0000-0001-7625-9148; IZP-9398-2023; K-7285-2012; AAG-7381-2021; HKN-2347-2023; AAU-8952-2020; F-4657-2014; CPH-1647-2022; KBR-5535-2024; KLE-8588-2024; EHB-5539-2022
The age-dependent role of Th22, Tc22, and Tc17 cells in the severity of pneumonia in COVID-19 immunopathogenesis
(Wiley, 2021-08) Şimşek, Abdurrahman; Çağan, Eren; Kızmaz, Muhammed Ali; Dombaz, Fatma; Tezcan, Gülçin; Asan, Ali; Demir, H. İbrahim; Bal, S. Haldun; Ermiş, Diğdem Yoyen; Demirdöğen, Ezgi; Heper, Yasemin; Akalın, E. Halis; Oral, Haluk Barbaros; Budak, Ferah; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; TEZCAN, GÜLÇİN; BAL, SALİH HALDUN; DEMİRDÖĞEN, EZGİ; BUDAK, FERAH; HEPER, YASEMİN; AKALIN, EMİN HALİS; Kızmaz, Muhammed Ali; Dombaz, Fatma; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; ORAL, HALUK BARBAROS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-5956-8755; 0000-0002-7400-9089; 0000-0001-7625-9148; AAG-7381-2021; HKN-2347-2023; DWR-5356-2022; KBR-5535-2024; GYL-2038-2022; AAH-9812-2021; CTY-9474-2022; AAU-8952-2020; IZP-9398-2023; K-7285-2012; AAH-3843-2020
The distribution of mature and/or immature myeloid cells and their role in effective anti-viral immune responses in COVID-19 positive patients
(Wiley, 2021-08-01) Ermiş, Diğdem Yöyen; Dömbaz, Fatma; Karaçay, Mehmet; Etgü, Onur; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimşek, Abdurrahman; Çağan, Eren; Aşan, Ali; Yılmaz, Emel; Kazak, Esra; Pınar, İbrahim Ethem; Bal, Salih Haldun; Arslan, Gözde; Karaca, Mert; Özkocaman, Vildan; Özkalemtaş, Fahir; Akalın, Emin Halis; Budak, Ferah; Oral, Haluk Barbaros; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; Dombaz, Fatma; Karaçay, Mehmet; Etgü, Onur; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; YILMAZ, EMEL; KAZAK, ESRA; PINAR, İBRAHİM ETHEM; BAL, SALİH HALDUN; Arslan, Gözde; KARACA, MERT; ÖZKOCAMAN, VİLDAN; Özkalemtaş, Fahir; AKALIN, EMİN HALİS; BUDAK, FERAH; ORAL, HALUK BARBAROS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Ana Bilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Rasit Durusoy Kan Bankası.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Hemotoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-7288-3250; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0002-8856-7356; 0000-0003-1785-3539; 0000-0001-7530-1279; 0000-0001-7625-9148; 0000-0003-0463-6818; KHE-5423-2024; AAU-8952-2020; HKN-2347-2023; JGM-6601-2023; JFS-2013-2023; AAG-7381-2021; K-7285-2012; IZP-9398-2023; F-4657-2014; JWP-2738-2024; GYL-2038-2022; DWR-5356-2022; CXY-4200-2022; CPT-2053-2022; GDP-0005-2022; AAG-8459-2021; FQJ-3657-2022; FQG-8981-2022