Browsing by Author "Karaçay, Mehmet"
Now showing 1 - 8 of 8
- Results Per Page
- Sort Options
Publication Evaluation of monocytic/granulocytic cells from spleen and liver in the experimental autoimmune encephalomyelitis mouse model(Wiley, 2021-08-01) Karaçay, Mehmet; Arslan, Gözde; Bayram, Gökçen Güvenç; Dombaz, Fatma; Etgü, Onur; Yumuşak, Ezgi; Ermiş, Diğdem Yöyen; Akkoç, Ahmet; Yalçın, Murat; Oral, Haluk Barbaros; Karacay, Mehmet; Arslan, Gozde; Dombaz, Fatma; Etgu, Onur; Yumusak, Ezgi; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; AKKOÇ, AHMET; YALÇIN, MURAT; ORAL, HALUK BARBAROS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Fizyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-5090-7917; 0000-0002-5600-8162; 0000-0003-0463-6818; JFS-2013-2023; K-7285-2012; HKW-7185-2023; AAG-6956-2021; CXY-4200-2022; DWR-5356-2022; CPT-2053-2022; GYL-2038-2022; DTZ-3578-2022Publication Evaluation of some blood parameters and percentage of CD4+or CD8+T cells from spleen and liver from the experimental autoimmune encephalomyelitis mouse model(Wiley, 2021-08-01) Arslan, Gözde; Karacay, Mehmet; Bayram, Gökçen Güvenç; Özoğlu, Efe; Dombaz, Fatma; Etgü, Onur; Yumuşak, Ezgi; Ermiş, Diğdem Yöyen; Akkoç, Ahmet; Yalçın, Murat; Oral, Haluk Barbaros; Arslan, Gözde; Karaçay, Mehmet; ÖZOĞLU, EFE; Dombaz, Fatma; Etgü, Onur; Yumuşak, Ezgi; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; AKKOÇ, AHMET; YALÇIN, MURAT; ORAL, HALUK BARBAROS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Fizyoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Biyokimya Anabilim Dalı.; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-5090-7917; 0000-0002-5600-8162; 0000-0003-0463-6818; K-7285-2012; AAG-6956-2021; JFS-2013-2023; HKW-7185-2023; CXY-4200-2022; FSU-7707-2022; DWR-5356-2022; JIJ-1849-2023; GYL-2038-2022; DTZ-3578-2022Item Evaluation of some blood parameters in the experimental autoimmune Encephalomyelitis mouse model(Bursa Uludağ Üniversitesi, 2021-10-29) Bayram, Gökçen Güvenç; Arslan, Gözde; Karaçay, Mehmet; Ermiş, Diğdem Yöyen; Özoğlu, Efe; Oral, Haluk Barbaros; Yalçın, Murat; Bursa Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Fizyoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Biyokimya Anabilim Dalı.; 0000-0001-7225-0138; 0000-0002-5301-6626; 0000-0001-5871-8769; 0000-0002-8939-8443; 0000-0003-0463-6818; 0000-0002-5600-8162; 0000-0002-1413-3651Multiple sclerosis (MS) is a chronic neuroinflammatory demyelinating disorder of the central nervous system with unclear exact etiology. The experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) model in C57BL/6 mice is the most common animal model for MS sharing many clinical and pathophysiological features to expand our knowledge on the pathophysiology of the disease and to develop novel treatment strategies. The current study was designed to determine hematological parameters and plasma total protein (TP) and albumin (ALB) levels in EAE-induced C57BL/6 mice to help researchers working on the EAE animal model. EAE was induced with myelin oligodendrocyte glycoprotein (MOG35-55) peptide in the female C57BL/6 mice. The EAE clinically caused paralyzed tail, hind limb paresis, and uncoordinated movement in the mice. The EAE-induced mice hematologically had a statistically significant mild increase in white blood cell (WBC) count without altering neutrophil-lymphocyte ratio but no change in vital hematological parameters such as red blood cell count, packed cell volume, and hemoglobin level. Moreover, the EAE led to an increase in the plasma TP level and attenuation in plasma ALB level in the mice. In conclusion, our findings show that the EAE model in mice might not cause any significant change hematologically, except a slight increase in the WBC count, and might produce changes in the plasma protein level. As the findings of the current study, the EAE-induced blood parameter effects could consider understanding the pathophysiology of the disease and developing a novel therapeutic approach for the disease.Item İnsan indolamin -2,3-dioksijenaz (İDO) geninin ELAM-1 promotoru kontrolünde klonlanması ve ekspresyonu(Uludağ Üniversitesi, 2017-04-28) Karaçay, Mehmet; Ersoy, Figen; Oral, H. Barbaros; Uludağ Üniversitesi/Fen Bilimleri Enstitüsü/Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı.İmmünolojik tolerans, antijen ile karşılaşan lenfositlerin yanıtsız kalması olarak tanımlanmıştır. İmmün sistem bazı patolojik durumlarda ve immün toleransın kırılması sonucunda, öz antijenlerine karşı duyarlı hale gelerek, kendi doku antijenlerine karşı reaksiyona geçmektedir. Böylece immün tolerans bozularak otoimmün hastalıklar ortaya çıkmaktadır. Otoimmün hastalıkların görülme sıklığı toplum genelinde %1-2 oranındadır. Birçok otoimmün hastalıkta triptofan aminoasit katabolizmasıyla ilgili teoriler ortaya atılmıştır. Triptofan aminoasit katabolizmasının başlangıç ve hız sınırlayıcı adımını gerçekleştiren İndolamin 2, 3-dioksijenaz (IDO), hücre içi bir enzimdir. IDO kullanımı sonucunda T hücre aktivasyonu baskılanırken, triptofanın katabolik ürünü olan kinürinin ve türevleri, serbest oksijen radikalleri gibi moleküller T hücre proliferasyonunu ve yaşamlarını düzenlerler. Endotel Lökosit Adezyon Molekülü- 1 (ELAM-1) lökositlerin enflamasyonlu dokulara göçünde yer alan bir molekülüdür. Normal koşullar altında endotel hücrelerde düşük düzeylerde eksprese edilir. Ayrıca endotel hücre kültürlerinde IL-1 (Interlökin-1) ve TNF (Tümör Nekroz Faktör) gibi sitokinler tarafından 4-6 saat gibi kısa bir sürede uyarılabilir. Bu tez çalışmasının amacı ELAM-1 promotor kontrolünde klonlanan IDO geninin sadece enflamasyon koşulları altında ekspresyonunu sağlamaktır. Bu amaçla hazırlanan plazmit memeli hücre hattı olan HeLa hücrelerine aktarılmış ve sitokinler aracılığı ile uyarılarak IDO aktivasyonu gözlemlenmiştir. IDO ekspresyonu ELISA, qRT-PZR ve Western blot analizleriyle gösterilmiştir. Bu çalışmanın devamında yapılması planlanan hayvan modelleme çalışmalarıyla birçok otoimmün hastalığa yeni bir gen tedavi yaklaşımı olarak kullanılıp kullanılmayacağı belirlenecektir.Publication Macrophage polarization capacity of peripheral blood monocytes and monocytic cell line THP-1 in response to secreted factors from COVID-19 patients(Wiley, 2021-08-01) Etgü, Onur; Karaçay, Mehmet; Dombaz, Fatma; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimsek, Abdurrahman; Asan, Ali; Yılmaz, Emel; Kazak, Esra; Pınar, İbrahim Ethem; Bal, Salih Haldün; Özkocaman, Vildan; Özkalemkaş, Fahir; Akalın, Emin Halis; Budak, Ferah; Oral, Haluk Barbaros; Ermiş, Diğdem Yöyen; Etgü, Onur; Karaçay, Mehmet; Dombaz, Fatma; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; YILMAZ, EMEL; KAZAK, ESRA; PINAR, İBRAHİM ETHEM; BAL, SALİH HALDUN; ÖZKOCAMAN, VİLDAN; ÖZKALEMKAŞ, FAHİR; AKALIN, EMİN HALİS; BUDAK, FERAH; ORAL, HALUK BARBAROS; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İç Hastalıkları Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Temel Tıp Bilimleri Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Dr Raşit Durusoy Kan Bankası.; 0000-0001-7288-3250; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0002-8856-7356; 0000-0003-1785-3539; 0000-0001-9907-1498; 0000-0001-7530-1279; 0000-0001-7625-9148; 0000-0003-0463-6818; JIJ-1849-2023; JHB-7829-2023; DWR-5356-2022; HKN-2347-2023; AAG-7381-2021; GDP-0005-2022; AAG-8459-2021; JGM-6601-2023; KBR-5535-2024; FQG-8981-2022; JIW-1248-2023; AAU-8952-2020; IZP-9398-2023; K-7285-2012; GYL-2038-2022Item Malign melanom hastalarında tümör ile ilişkili antijenlerin belirlenmesi(Bursa Uludağ Üniversitesi, 2023-07-18) Karaçay, Mehmet; Oral, Haluk Barbaros; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; 0000-0002-5301-6626Adoptif hücre tedavileri (ACT) son yıllarda malign melanomlu hastalar için mevcut en iyi immünoterapi seçeneklerinden biridir. Tümörün baskılayıcı mikroçevresinden dolayı anti-tümör immün yanıtların yetersiz kalması, kansere bağlı ölümlerin artmasına neden olmaktadır. Verimli bir tedavi yaklaşımı için geniş bir hasta grubunun antijen özgüllüklerinin, önceden tanımlanmış olması oldukça önemlidir. Bu nedenle çalışmamızda malign melanomun farklı alt grup ve evrelerinde benzerlik ve ortaklık gösteren hücre içi antijenlerin tanımlanması amaçlanmıştır. Çalışmamızda kutanöz, üveal ve mukozal melanomlu hastaların doku örneklerinin hem in situ hem de invaziv alanlarında, literatürde daha önce melanom ile ilişkilendirilmiş MART-1, HMB-45, TYR, TRP-1, TRP-2, MAGE-A, MAGE-C1 ve NY-ESO-1 antijenlerinin ifade düzeyleri belirlenmiştir. Çalışmanın sonucunda, hasta kontrol gruplarına kıyasla, HMB-45, MAGE-A ve MAGE-C1 antijenlerinin, melanom dokularının in situ ve invaziv alanlarında ve tüm alt grup ve evrelerinde benzer şekilde, istatistiksel olarak anlamlı derece yüksek ifade edildikleri tespit edilmiştir. Ayrıca bu antijenlerin, hastalığın metastatik evrelerinde primer evrelerine kıyasla daha yüksek ifade edildikleri de gözlemlenmiştir. Belirlenen HMB-45, MAGE-A ve MAGE-C1 antijenlerinin tanınmasına yönelik gerçekleştirilecek immünoterapi yaklaşımları sayesinde efektif anti-tümör immün yanıtların artması, metastazların kontrol altına alınması ve melanoma bağlı ölümlerin azalmasına aracılık edebileceği düşünülmektedir.Publication The distribution of mature and/or immature myeloid cells and their role in effective anti-viral immune responses in COVID-19 positive patients(Wiley, 2021-08-01) Ermiş, Diğdem Yöyen; Dömbaz, Fatma; Karaçay, Mehmet; Etgü, Onur; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimşek, Abdurrahman; Çağan, Eren; Aşan, Ali; Yılmaz, Emel; Kazak, Esra; Pınar, İbrahim Ethem; Bal, Salih Haldun; Arslan, Gözde; Karaca, Mert; Özkocaman, Vildan; Özkalemtaş, Fahir; Akalın, Emin Halis; Budak, Ferah; Oral, Haluk Barbaros; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; Dombaz, Fatma; Karaçay, Mehmet; Etgü, Onur; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; YILMAZ, EMEL; KAZAK, ESRA; PINAR, İBRAHİM ETHEM; BAL, SALİH HALDUN; Arslan, Gözde; KARACA, MERT; ÖZKOCAMAN, VİLDAN; Özkalemtaş, Fahir; AKALIN, EMİN HALİS; BUDAK, FERAH; ORAL, HALUK BARBAROS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Ana Bilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Rasit Durusoy Kan Bankası.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Hemotoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-7288-3250; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0002-8856-7356; 0000-0003-1785-3539; 0000-0001-7530-1279; 0000-0001-7625-9148; 0000-0003-0463-6818; KHE-5423-2024; AAU-8952-2020; HKN-2347-2023; JGM-6601-2023; JFS-2013-2023; AAG-7381-2021; K-7285-2012; IZP-9398-2023; F-4657-2014; JWP-2738-2024; GYL-2038-2022; DWR-5356-2022; CXY-4200-2022; CPT-2053-2022; GDP-0005-2022; AAG-8459-2021; FQJ-3657-2022; FQG-8981-2022Publication The impact of gamma irradiation on exosome profiles and electrolyte levels in apheresis platelet concentrates(Wiley, 2021-08-01) Bal, Salih Haldun; Karaçay, Mehmet; Kızmaz, Muhammed Ali; Kumaş, Levent Tufan; Can, Fatma Ezgi; Gülkaya, Deniz Koşay; Ermiş, Diğdem Yöyen; Budak, Ferah; Heper, Yasemin; Oral, Haluk Barbaros; BAL, SALİH HALDUN; Karaçay, Mehmet; Kızmaz, Muhammed Ali; Kumaş, Levent Tufan; Can, Fatma Ezgi; Gülkaya, Deniz Koşay; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; BUDAK, FERAH; HEPER, YASEMİN; ORAL, HALUK BARBAROS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Dr. Raşit Durusoy Kan Bankası.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmunoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Bioistatistik Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-7625-9148; 0000-0003-0463-6818; JSL-7718-2023; HKN-2347-2023; K-7285-2012; F-4657-2014; IZP-9398-2023; KBR-5535-2024; JHB-7829-2023; FHB-1791-2022; CSL-9726-2022; GYL-2038-2022; HOK-0035-2023; CTY-9474-2022